Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atl3Q91YH5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atl3Q91YH5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atl3Q91YH5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atl3Q91YH5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms