Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Synpo2Q91YE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Synpo2Q91YE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Synpo2Q91YE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms