Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdkal1Q91WE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkal1Q91WE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkal1Q91WE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkal1Q91WE6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkal1Q91WE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms