Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATL1Q8WXF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL1Q8WXF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms