Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF31Q8WWY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF31Q8WWY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF31Q8WWY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF31Q8WWY3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms