Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q2Q8WVN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■■□□ 2
UBE2Q2Q8WVN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q2Q8WVN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2Q2Q8WVN8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q2Q8WVN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms