Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC107Q8WV48 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC107Q8WV48 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms