Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSKUQ8WUA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSKUQ8WUA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms