Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps4aQ8VEJ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps4aQ8VEJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps4aQ8VEJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms