Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BbxQ8VBW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BbxQ8VBW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BbxQ8VBW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms