Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC3Q8TF64 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC3Q8TF64 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC3Q8TF64 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms