Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP9Q8TA86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP9Q8TA86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms