Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpsap2Q8R574 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap2Q8R574 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap2Q8R574 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap2Q8R574 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms