Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Y2

Mcam, Cell surface glycoprotein MUC18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McamQ8R2Y2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
McamQ8R2Y2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
McamQ8R2Y2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
McamQ8R2Y2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
McamQ8R2Y2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
McamQ8R2Y2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
McamQ8R2Y2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
McamQ8R2Y2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms