Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps37cQ8R105 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps37cQ8R105 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps37cQ8R105 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps37cQ8R105 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms