Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BEST4Q8NFU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BEST4Q8NFU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BEST4Q8NFU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms