Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPATA4Q8NEY3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPATA4Q8NEY3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPATA4Q8NEY3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms