Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX2

SLC17A8, Vesicular glutamate transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A8Q8NDX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC17A8Q8NDX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC17A8Q8NDX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC17A8Q8NDX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC17A8Q8NDX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC17A8Q8NDX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC17A8Q8NDX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC17A8Q8NDX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC17A8Q8NDX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms