Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf163Q8N9P6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf163Q8N9P6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf163Q8N9P6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms