Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMER3Q8N944 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMER3Q8N944 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AMER3Q8N944 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms