Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCD7Q8N8D1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD7Q8N8D1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms