Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC82Q8N4S0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC82Q8N4S0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC82Q8N4S0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms