Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LNX2Q8N448 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LNX2Q8N448 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNX2Q8N448 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.7 ms