Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR16C5Q8N3Y7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR16C5Q8N3Y7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR16C5Q8N3Y7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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