Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1KQ8N3J5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1KQ8N3J5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1KQ8N3J5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPM1KQ8N3J5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPM1KQ8N3J5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1KQ8N3J5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1KQ8N3J5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms