Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C17orf53Q8N3J3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C17orf53Q8N3J3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C17orf53Q8N3J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms