Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXPE1Q8N323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXPE1Q8N323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE1Q8N323 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE1Q8N323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE1Q8N323 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms