Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
VWDEQ8N2E2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
VWDEQ8N2E2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
VWDEQ8N2E2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
VWDEQ8N2E2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VWDEQ8N2E2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms