Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G9

Appl2, DCC-interacting protein 13-beta, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl2Q8K3G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Appl2Q8K3G9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Appl2Q8K3G9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Appl2Q8K3G9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Appl2Q8K3G9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Appl2Q8K3G9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Appl2Q8K3G9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Appl2Q8K3G9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms