Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp45Q8K387 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp45Q8K387 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp45Q8K387 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp45Q8K387 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms