Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trappc12Q8K2L8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trappc12Q8K2L8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc12Q8K2L8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc12Q8K2L8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trappc12Q8K2L8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc12Q8K2L8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc12Q8K2L8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms