Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1eQ8K202 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1eQ8K202 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1eQ8K202 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1049.5 ms