Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APLFQ8IW19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APLFQ8IW19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms