Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGA4Q8IV77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA4Q8IV77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms