Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC71Q8IV32 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC71Q8IV32 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC71Q8IV32 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms