Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mterf1aQ8CHZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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