Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc87Q8CDL9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc87Q8CDL9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc87Q8CDL9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms