Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
6030452D12RikQ8CD33 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
6030452D12RikQ8CD33 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
6030452D12RikQ8CD33 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
6030452D12RikQ8CD33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms