Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ufl1Q8CCJ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ufl1Q8CCJ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms