Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scara3Q8C850 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scara3Q8C850 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara3Q8C850 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scara3Q8C850 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms