Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CrbnQ8C7D2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CrbnQ8C7D2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CrbnQ8C7D2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CrbnQ8C7D2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CrbnQ8C7D2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CrbnQ8C7D2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms