Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot2Q8C5L3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot2Q8C5L3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot2Q8C5L3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot2Q8C5L3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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