Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc60Q8C4J0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc60Q8C4J0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc60Q8C4J0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc60Q8C4J0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc60Q8C4J0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc60Q8C4J0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms