Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trerf1Q8BXJ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trerf1Q8BXJ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trerf1Q8BXJ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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