Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4aQ8BU40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4aQ8BU40 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp4aQ8BU40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4aQ8BU40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms