Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd4aQ8BIE6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Frmd4aQ8BIE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd4aQ8BIE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms