Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4dQ8BGV9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4dQ8BGV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4dQ8BGV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4dQ8BGV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms