Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubash3bQ8BGG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubash3bQ8BGG7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubash3bQ8BGG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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