Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim65Q8BFW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim65Q8BFW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim65Q8BFW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms