Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREML1Q86YW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREML1Q86YW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TREML1Q86YW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms